Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna1cQ01815 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms