Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pde1bQ01065 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pde1bQ01065 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms