Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Scn1bP97952 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms