Protein–RNA interactions for Protein: P97801

Smn1, Survival motor neuron protein, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smn1P97801 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smn1P97801 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smn1P97801 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smn1P97801 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smn1P97801 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smn1P97801 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smn1P97801 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smn1P97801 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smn1P97801 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smn1P97801 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smn1P97801 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smn1P97801 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smn1P97801 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smn1P97801 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smn1P97801 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smn1P97801 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smn1P97801 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smn1P97801 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smn1P97801 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smn1P97801 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smn1P97801 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smn1P97801 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smn1P97801 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smn1P97801 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smn1P97801 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smn1P97801 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smn1P97801 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smn1P97801 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smn1P97801 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smn1P97801 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smn1P97801 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smn1P97801 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smn1P97801 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smn1P97801 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smn1P97801 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smn1P97801 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smn1P97801 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smn1P97801 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smn1P97801 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smn1P97801 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smn1P97801 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smn1P97801 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smn1P97801 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smn1P97801 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smn1P97801 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smn1P97801 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smn1P97801 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smn1P97801 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smn1P97801 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smn1P97801 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smn1P97801 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smn1P97801 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smn1P97801 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smn1P97801 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smn1P97801 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smn1P97801 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smn1P97801 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smn1P97801 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smn1P97801 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smn1P97801 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smn1P97801 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smn1P97801 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smn1P97801 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smn1P97801 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smn1P97801 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smn1P97801 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smn1P97801 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smn1P97801 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smn1P97801 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smn1P97801 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smn1P97801 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smn1P97801 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smn1P97801 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smn1P97801 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smn1P97801 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smn1P97801 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smn1P97801 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smn1P97801 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smn1P97801 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smn1P97801 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smn1P97801 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smn1P97801 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smn1P97801 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smn1P97801 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smn1P97801 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smn1P97801 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smn1P97801 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smn1P97801 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smn1P97801 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smn1P97801 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smn1P97801 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smn1P97801 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smn1P97801 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smn1P97801 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smn1P97801 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smn1P97801 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smn1P97801 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smn1P97801 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smn1P97801 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smn1P97801 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms