Protein–RNA interactions for Protein: P97489

Gata5, Transcription factor GATA-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata5P97489 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gata5P97489 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gata5P97489 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gata5P97489 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gata5P97489 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gata5P97489 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gata5P97489 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gata5P97489 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gata5P97489 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gata5P97489 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gata5P97489 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gata5P97489 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gata5P97489 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gata5P97489 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gata5P97489 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gata5P97489 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gata5P97489 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gata5P97489 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gata5P97489 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gata5P97489 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms