Protein–RNA interactions for Protein: P97459

Npas1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas1P97459 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Npas1P97459 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Npas1P97459 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Npas1P97459 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Npas1P97459 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Npas1P97459 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Npas1P97459 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Npas1P97459 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas1P97459 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas1P97459 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms