Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RhodP97348 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RhodP97348 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RhodP97348 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RhodP97348 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RhodP97348 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RhodP97348 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RhodP97348 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RhodP97348 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RhodP97348 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RhodP97348 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RhodP97348 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RhodP97348 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RhodP97348 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RhodP97348 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RhodP97348 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RhodP97348 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RhodP97348 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RhodP97348 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RhodP97348 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RhodP97348 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RhodP97348 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RhodP97348 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RhodP97348 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RhodP97348 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RhodP97348 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RhodP97348 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RhodP97348 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RhodP97348 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RhodP97348 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RhodP97348 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RhodP97348 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RhodP97348 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RhodP97348 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RhodP97348 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RhodP97348 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RhodP97348 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RhodP97348 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RhodP97348 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RhodP97348 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RhodP97348 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RhodP97348 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RhodP97348 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RhodP97348 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RhodP97348 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RhodP97348 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RhodP97348 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RhodP97348 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RhodP97348 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RhodP97348 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RhodP97348 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RhodP97348 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RhodP97348 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhodP97348 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhodP97348 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhodP97348 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhodP97348 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhodP97348 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhodP97348 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhodP97348 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhodP97348 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhodP97348 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhodP97348 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RhodP97348 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhodP97348 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RhodP97348 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhodP97348 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhodP97348 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhodP97348 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhodP97348 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhodP97348 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhodP97348 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhodP97348 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhodP97348 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhodP97348 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhodP97348 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhodP97348 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhodP97348 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhodP97348 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RhodP97348 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhodP97348 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhodP97348 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RhodP97348 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhodP97348 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhodP97348 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhodP97348 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhodP97348 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhodP97348 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhodP97348 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhodP97348 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhodP97348 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhodP97348 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhodP97348 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhodP97348 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RhodP97348 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhodP97348 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhodP97348 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhodP97348 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhodP97348 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhodP97348 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms