Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mesp1P97309 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mesp1P97309 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mesp1P97309 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mesp1P97309 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mesp1P97309 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mesp1P97309 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mesp1P97309 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mesp1P97309 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mesp1P97309 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mesp1P97309 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms