Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vgll3P85442 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vgll3P85442 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms