Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gabpb2P81069 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gabpb2P81069 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gabpb2P81069 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Gabpb2P81069 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gabpb2P81069 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gabpb2P81069 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gabpb2P81069 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gabpb2P81069 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gabpb2P81069 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gabpb2P81069 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gabpb2P81069 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gabpb2P81069 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gabpb2P81069 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gabpb2P81069 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gabpb2P81069 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gabpb2P81069 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gabpb2P81069 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gabpb2P81069 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gabpb2P81069 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gabpb2P81069 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gabpb2P81069 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gabpb2P81069 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gabpb2P81069 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gabpb2P81069 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gabpb2P81069 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gabpb2P81069 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gabpb2P81069 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gabpb2P81069 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gabpb2P81069 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gabpb2P81069 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gabpb2P81069 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gabpb2P81069 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gabpb2P81069 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gabpb2P81069 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gabpb2P81069 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gabpb2P81069 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gabpb2P81069 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gabpb2P81069 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gabpb2P81069 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gabpb2P81069 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gabpb2P81069 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gabpb2P81069 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gabpb2P81069 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gabpb2P81069 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gabpb2P81069 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gabpb2P81069 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gabpb2P81069 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gabpb2P81069 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gabpb2P81069 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gabpb2P81069 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gabpb2P81069 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms