Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx2P81066 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx2P81066 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx2P81066 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx2P81066 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx2P81066 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx2P81066 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx2P81066 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx2P81066 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Irx2P81066 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms