Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Polr1bP70700 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms