Protein–RNA interactions for Protein: P70271

Pdlim4, PDZ and LIM domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim4P70271 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdlim4P70271 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdlim4P70271 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pdlim4P70271 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdlim4P70271 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdlim4P70271 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdlim4P70271 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdlim4P70271 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pdlim4P70271 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdlim4P70271 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdlim4P70271 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdlim4P70271 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdlim4P70271 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdlim4P70271 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdlim4P70271 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdlim4P70271 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdlim4P70271 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdlim4P70271 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdlim4P70271 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdlim4P70271 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdlim4P70271 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdlim4P70271 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdlim4P70271 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdlim4P70271 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms