Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms