Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chl1P70232 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chl1P70232 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chl1P70232 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chl1P70232 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chl1P70232 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chl1P70232 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chl1P70232 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chl1P70232 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Chl1P70232 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chl1P70232 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chl1P70232 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Chl1P70232 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chl1P70232 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chl1P70232 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chl1P70232 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chl1P70232 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chl1P70232 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chl1P70232 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chl1P70232 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chl1P70232 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chl1P70232 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chl1P70232 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chl1P70232 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chl1P70232 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chl1P70232 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chl1P70232 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chl1P70232 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chl1P70232 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chl1P70232 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chl1P70232 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chl1P70232 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chl1P70232 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chl1P70232 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chl1P70232 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chl1P70232 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chl1P70232 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chl1P70232 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chl1P70232 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chl1P70232 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chl1P70232 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chl1P70232 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chl1P70232 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chl1P70232 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Chl1P70232 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Chl1P70232 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chl1P70232 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chl1P70232 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chl1P70232 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chl1P70232 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Chl1P70232 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chl1P70232 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chl1P70232 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chl1P70232 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chl1P70232 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chl1P70232 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chl1P70232 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chl1P70232 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chl1P70232 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Chl1P70232 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chl1P70232 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chl1P70232 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chl1P70232 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chl1P70232 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Chl1P70232 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chl1P70232 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chl1P70232 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chl1P70232 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chl1P70232 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chl1P70232 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chl1P70232 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chl1P70232 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Chl1P70232 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chl1P70232 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chl1P70232 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chl1P70232 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chl1P70232 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Chl1P70232 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chl1P70232 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chl1P70232 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chl1P70232 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Chl1P70232 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chl1P70232 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chl1P70232 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Chl1P70232 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chl1P70232 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chl1P70232 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chl1P70232 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chl1P70232 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chl1P70232 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chl1P70232 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chl1P70232 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chl1P70232 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chl1P70232 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chl1P70232 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chl1P70232 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chl1P70232 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chl1P70232 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chl1P70232 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chl1P70232 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms