Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hoxd13P70217 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms