Protein–RNA interactions for Protein: P70194

Clec4f, C-type lectin domain family 4 member F, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4fP70194 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clec4fP70194 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clec4fP70194 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clec4fP70194 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clec4fP70194 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clec4fP70194 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clec4fP70194 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clec4fP70194 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clec4fP70194 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clec4fP70194 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clec4fP70194 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clec4fP70194 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clec4fP70194 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clec4fP70194 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clec4fP70194 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clec4fP70194 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clec4fP70194 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clec4fP70194 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clec4fP70194 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms