Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms