Protein–RNA interactions for Protein: P63044

Vamp2, Vesicle-associated membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp2P63044 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms