Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps3P62908 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps3P62908 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps3P62908 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps3P62908 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps3P62908 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps3P62908 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps3P62908 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms