Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3cP62823 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3cP62823 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3cP62823 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3cP62823 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3cP62823 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3cP62823 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3cP62823 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3cP62823 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3cP62823 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3cP62823 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3cP62823 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3cP62823 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3cP62823 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3cP62823 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3cP62823 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3cP62823 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3cP62823 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3cP62823 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3cP62823 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3cP62823 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3cP62823 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3cP62823 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3cP62823 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3cP62823 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3cP62823 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3cP62823 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3cP62823 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3cP62823 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3cP62823 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3cP62823 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3cP62823 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3cP62823 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms