Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vsnl1P62761 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vsnl1P62761 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vsnl1P62761 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vsnl1P62761 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vsnl1P62761 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vsnl1P62761 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vsnl1P62761 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vsnl1P62761 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vsnl1P62761 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vsnl1P62761 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vsnl1P62761 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Vsnl1P62761 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vsnl1P62761 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vsnl1P62761 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vsnl1P62761 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vsnl1P62761 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vsnl1P62761 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vsnl1P62761 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vsnl1P62761 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vsnl1P62761 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vsnl1P62761 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vsnl1P62761 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vsnl1P62761 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vsnl1P62761 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vsnl1P62761 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vsnl1P62761 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms