Protein–RNA interactions for Protein: P62737

Acta2, Actin, aortic smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta2P62737 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Acta2P62737 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Acta2P62737 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Acta2P62737 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acta2P62737 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acta2P62737 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Acta2P62737 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acta2P62737 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acta2P62737 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acta2P62737 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acta2P62737 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acta2P62737 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acta2P62737 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acta2P62737 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acta2P62737 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Acta2P62737 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acta2P62737 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acta2P62737 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acta2P62737 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Acta2P62737 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acta2P62737 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acta2P62737 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acta2P62737 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acta2P62737 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acta2P62737 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acta2P62737 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acta2P62737 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acta2P62737 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acta2P62737 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acta2P62737 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Acta2P62737 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acta2P62737 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acta2P62737 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acta2P62737 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acta2P62737 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acta2P62737 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acta2P62737 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acta2P62737 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acta2P62737 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acta2P62737 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acta2P62737 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acta2P62737 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acta2P62737 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acta2P62737 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acta2P62737 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acta2P62737 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acta2P62737 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acta2P62737 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acta2P62737 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Acta2P62737 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acta2P62737 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acta2P62737 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acta2P62737 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acta2P62737 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acta2P62737 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acta2P62737 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acta2P62737 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acta2P62737 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acta2P62737 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acta2P62737 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acta2P62737 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acta2P62737 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acta2P62737 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Acta2P62737 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acta2P62737 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acta2P62737 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acta2P62737 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Acta2P62737 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acta2P62737 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Acta2P62737 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acta2P62737 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acta2P62737 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acta2P62737 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acta2P62737 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acta2P62737 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Acta2P62737 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acta2P62737 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms