Protein–RNA interactions for Protein: P61588

Rnd3, Rho-related GTP-binding protein RhoE, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnd3P61588 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnd3P61588 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnd3P61588 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnd3P61588 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnd3P61588 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnd3P61588 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnd3P61588 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnd3P61588 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnd3P61588 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnd3P61588 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnd3P61588 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnd3P61588 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rnd3P61588 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnd3P61588 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rnd3P61588 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnd3P61588 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnd3P61588 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnd3P61588 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnd3P61588 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnd3P61588 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnd3P61588 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnd3P61588 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rnd3P61588 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rnd3P61588 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnd3P61588 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnd3P61588 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnd3P61588 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnd3P61588 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnd3P61588 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnd3P61588 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnd3P61588 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnd3P61588 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnd3P61588 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnd3P61588 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rnd3P61588 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnd3P61588 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnd3P61588 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnd3P61588 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnd3P61588 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnd3P61588 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnd3P61588 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnd3P61588 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnd3P61588 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnd3P61588 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnd3P61588 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnd3P61588 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnd3P61588 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnd3P61588 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnd3P61588 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rnd3P61588 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnd3P61588 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnd3P61588 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnd3P61588 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnd3P61588 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnd3P61588 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rnd3P61588 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnd3P61588 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnd3P61588 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnd3P61588 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnd3P61588 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnd3P61588 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnd3P61588 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnd3P61588 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnd3P61588 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnd3P61588 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnd3P61588 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnd3P61588 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rnd3P61588 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnd3P61588 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnd3P61588 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnd3P61588 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnd3P61588 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnd3P61588 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnd3P61588 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnd3P61588 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnd3P61588 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnd3P61588 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rnd3P61588 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rnd3P61588 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnd3P61588 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnd3P61588 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnd3P61588 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnd3P61588 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnd3P61588 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnd3P61588 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnd3P61588 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rnd3P61588 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnd3P61588 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnd3P61588 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rnd3P61588 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnd3P61588 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnd3P61588 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rnd3P61588 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnd3P61588 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnd3P61588 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnd3P61588 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnd3P61588 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rnd3P61588 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnd3P61588 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rnd3P61588 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms