Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smg6P61406 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smg6P61406 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smg6P61406 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smg6P61406 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smg6P61406 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smg6P61406 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smg6P61406 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smg6P61406 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smg6P61406 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smg6P61406 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smg6P61406 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Smg6P61406 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smg6P61406 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smg6P61406 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smg6P61406 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smg6P61406 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smg6P61406 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smg6P61406 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smg6P61406 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smg6P61406 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smg6P61406 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Smg6P61406 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Smg6P61406 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smg6P61406 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smg6P61406 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smg6P61406 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smg6P61406 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Smg6P61406 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smg6P61406 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smg6P61406 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smg6P61406 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smg6P61406 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Smg6P61406 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smg6P61406 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smg6P61406 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smg6P61406 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smg6P61406 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smg6P61406 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smg6P61406 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smg6P61406 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Smg6P61406 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smg6P61406 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smg6P61406 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smg6P61406 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smg6P61406 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Smg6P61406 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smg6P61406 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smg6P61406 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smg6P61406 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smg6P61406 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smg6P61406 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smg6P61406 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smg6P61406 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smg6P61406 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smg6P61406 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smg6P61406 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smg6P61406 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smg6P61406 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smg6P61406 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Smg6P61406 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smg6P61406 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smg6P61406 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smg6P61406 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smg6P61406 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smg6P61406 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Smg6P61406 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smg6P61406 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smg6P61406 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Smg6P61406 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smg6P61406 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smg6P61406 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smg6P61406 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Smg6P61406 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smg6P61406 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smg6P61406 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smg6P61406 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smg6P61406 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smg6P61406 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smg6P61406 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smg6P61406 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smg6P61406 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smg6P61406 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smg6P61406 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smg6P61406 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smg6P61406 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smg6P61406 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smg6P61406 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smg6P61406 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smg6P61406 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smg6P61406 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smg6P61406 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smg6P61406 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smg6P61406 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smg6P61406 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smg6P61406 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smg6P61406 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smg6P61406 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smg6P61406 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smg6P61406 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms