Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ActbP60710 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ActbP60710 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ActbP60710 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ActbP60710 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ActbP60710 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ActbP60710 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ActbP60710 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ActbP60710 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ActbP60710 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ActbP60710 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ActbP60710 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ActbP60710 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ActbP60710 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ActbP60710 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ActbP60710 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ActbP60710 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ActbP60710 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ActbP60710 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ActbP60710 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ActbP60710 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ActbP60710 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ActbP60710 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ActbP60710 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ActbP60710 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ActbP60710 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ActbP60710 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ActbP60710 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ActbP60710 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ActbP60710 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ActbP60710 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ActbP60710 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ActbP60710 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ActbP60710 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ActbP60710 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ActbP60710 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ActbP60710 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ActbP60710 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ActbP60710 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ActbP60710 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ActbP60710 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ActbP60710 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ActbP60710 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ActbP60710 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ActbP60710 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ActbP60710 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ActbP60710 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ActbP60710 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ActbP60710 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ActbP60710 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ActbP60710 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ActbP60710 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ActbP60710 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ActbP60710 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ActbP60710 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ActbP60710 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ActbP60710 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ActbP60710 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ActbP60710 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ActbP60710 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ActbP60710 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ActbP60710 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ActbP60710 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ActbP60710 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ActbP60710 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ActbP60710 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ActbP60710 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ActbP60710 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ActbP60710 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ActbP60710 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ActbP60710 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ActbP60710 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ActbP60710 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ActbP60710 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ActbP60710 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ActbP60710 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ActbP60710 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ActbP60710 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ActbP60710 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ActbP60710 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ActbP60710 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ActbP60710 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ActbP60710 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ActbP60710 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ActbP60710 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ActbP60710 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ActbP60710 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ActbP60710 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ActbP60710 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ActbP60710 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ActbP60710 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ActbP60710 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ActbP60710 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ActbP60710 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ActbP60710 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ActbP60710 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ActbP60710 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ActbP60710 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ActbP60710 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ActbP60710 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms