Protein–RNA interactions for Protein: P60229

Eif3e, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3eP60229 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif3eP60229 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif3eP60229 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif3eP60229 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif3eP60229 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif3eP60229 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif3eP60229 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif3eP60229 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif3eP60229 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif3eP60229 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eif3eP60229 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eif3eP60229 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eif3eP60229 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eif3eP60229 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eif3eP60229 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eif3eP60229 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eif3eP60229 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eif3eP60229 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eif3eP60229 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eif3eP60229 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eif3eP60229 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Eif3eP60229 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eif3eP60229 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eif3eP60229 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eif3eP60229 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eif3eP60229 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eif3eP60229 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms