Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hps5P59438 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hps5P59438 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hps5P59438 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Hps5P59438 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hps5P59438 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hps5P59438 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hps5P59438 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hps5P59438 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms