Protein–RNA interactions for Protein: P59235

Nup43, Nucleoporin Nup43, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup43P59235 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup43P59235 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup43P59235 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup43P59235 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup43P59235 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup43P59235 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup43P59235 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup43P59235 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup43P59235 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nup43P59235 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nup43P59235 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nup43P59235 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms