Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Strn4P58404 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Strn4P58404 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Strn4P58404 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Strn4P58404 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Strn4P58404 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Strn4P58404 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Strn4P58404 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Strn4P58404 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Strn4P58404 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Strn4P58404 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Strn4P58404 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Strn4P58404 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Strn4P58404 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Strn4P58404 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Strn4P58404 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Strn4P58404 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Strn4P58404 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Strn4P58404 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Strn4P58404 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Strn4P58404 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Strn4P58404 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Strn4P58404 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Strn4P58404 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Strn4P58404 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Strn4P58404 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Strn4P58404 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Strn4P58404 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Strn4P58404 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Strn4P58404 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Strn4P58404 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Strn4P58404 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Strn4P58404 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Strn4P58404 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Strn4P58404 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Strn4P58404 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Strn4P58404 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Strn4P58404 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Strn4P58404 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Strn4P58404 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Strn4P58404 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Strn4P58404 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Strn4P58404 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Strn4P58404 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Strn4P58404 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Strn4P58404 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Strn4P58404 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Strn4P58404 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Strn4P58404 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Strn4P58404 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Strn4P58404 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Strn4P58404 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Strn4P58404 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Strn4P58404 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Strn4P58404 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Strn4P58404 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Strn4P58404 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Strn4P58404 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Strn4P58404 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Strn4P58404 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Strn4P58404 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Strn4P58404 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Strn4P58404 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Strn4P58404 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Strn4P58404 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Strn4P58404 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Strn4P58404 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Strn4P58404 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Strn4P58404 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Strn4P58404 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Strn4P58404 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Strn4P58404 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Strn4P58404 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Strn4P58404 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Strn4P58404 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Strn4P58404 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Strn4P58404 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Strn4P58404 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Strn4P58404 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Strn4P58404 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Strn4P58404 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Strn4P58404 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Strn4P58404 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Strn4P58404 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Strn4P58404 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Strn4P58404 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Strn4P58404 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Strn4P58404 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Strn4P58404 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Strn4P58404 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Strn4P58404 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Strn4P58404 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Strn4P58404 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Strn4P58404 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Strn4P58404 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Strn4P58404 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Strn4P58404 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Strn4P58404 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Strn4P58404 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Strn4P58404 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms