Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtnsP57757 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtnsP57757 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtnsP57757 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtnsP57757 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtnsP57757 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtnsP57757 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtnsP57757 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtnsP57757 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CtnsP57757 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CtnsP57757 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtnsP57757 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtnsP57757 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtnsP57757 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CtnsP57757 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CtnsP57757 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CtnsP57757 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CtnsP57757 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CtnsP57757 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CtnsP57757 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CtnsP57757 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CtnsP57757 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CtnsP57757 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CtnsP57757 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CtnsP57757 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CtnsP57757 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CtnsP57757 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CtnsP57757 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CtnsP57757 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CtnsP57757 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CtnsP57757 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CtnsP57757 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CtnsP57757 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CtnsP57757 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CtnsP57757 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CtnsP57757 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtnsP57757 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms