Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd38P56528 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd38P56528 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd38P56528 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd38P56528 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd38P56528 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd38P56528 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd38P56528 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd38P56528 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd38P56528 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd38P56528 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd38P56528 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms