Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CckbrP56481 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CckbrP56481 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CckbrP56481 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CckbrP56481 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CckbrP56481 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CckbrP56481 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CckbrP56481 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CckbrP56481 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CckbrP56481 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CckbrP56481 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CckbrP56481 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CckbrP56481 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CckbrP56481 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CckbrP56481 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CckbrP56481 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms