Protein–RNA interactions for Protein: P56475

Gabrr1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrr1P56475 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrr1P56475 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrr1P56475 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrr1P56475 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrr1P56475 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrr1P56475 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrr1P56475 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrr1P56475 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrr1P56475 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrr1P56475 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrr1P56475 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrr1P56475 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrr1P56475 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrr1P56475 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrr1P56475 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrr1P56475 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrr1P56475 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrr1P56475 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrr1P56475 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrr1P56475 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrr1P56475 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrr1P56475 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrr1P56475 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrr1P56475 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrr1P56475 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrr1P56475 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrr1P56475 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrr1P56475 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrr1P56475 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrr1P56475 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrr1P56475 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrr1P56475 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrr1P56475 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrr1P56475 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrr1P56475 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrr1P56475 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrr1P56475 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrr1P56475 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrr1P56475 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrr1P56475 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrr1P56475 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrr1P56475 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms