Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GferP56213 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GferP56213 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GferP56213 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GferP56213 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GferP56213 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GferP56213 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GferP56213 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GferP56213 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GferP56213 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GferP56213 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GferP56213 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GferP56213 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GferP56213 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GferP56213 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GferP56213 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GferP56213 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GferP56213 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GferP56213 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GferP56213 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GferP56213 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GferP56213 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GferP56213 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GferP56213 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GferP56213 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GferP56213 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GferP56213 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GferP56213 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GferP56213 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GferP56213 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GferP56213 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GferP56213 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GferP56213 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GferP56213 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GferP56213 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.05■□□□□ 0
GferP56213 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GferP56213 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GferP56213 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GferP56213 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GferP56213 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GferP56213 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GferP56213 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GferP56213 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
GferP56213 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GferP56213 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
GferP56213 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GferP56213 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GferP56213 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GferP56213 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GferP56213 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GferP56213 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GferP56213 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GferP56213 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GferP56213 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GferP56213 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GferP56213 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GferP56213 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GferP56213 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GferP56213 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GferP56213 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GferP56213 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GferP56213 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GferP56213 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GferP56213 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GferP56213 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GferP56213 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GferP56213 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GferP56213 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GferP56213 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GferP56213 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GferP56213 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GferP56213 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GferP56213 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
GferP56213 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GferP56213 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GferP56213 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GferP56213 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GferP56213 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GferP56213 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GferP56213 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GferP56213 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GferP56213 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GferP56213 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GferP56213 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GferP56213 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GferP56213 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GferP56213 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GferP56213 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GferP56213 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GferP56213 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GferP56213 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GferP56213 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GferP56213 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GferP56213 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GferP56213 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GferP56213 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GferP56213 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GferP56213 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GferP56213 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GferP56213 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms