Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cacnb3P54285 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Cacnb3P54285 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cacnb3P54285 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cacnb3P54285 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cacnb3P54285 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cacnb3P54285 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cacnb3P54285 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacnb3P54285 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacnb3P54285 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacnb3P54285 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cacnb3P54285 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacnb3P54285 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacnb3P54285 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cacnb3P54285 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Cacnb3P54285 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cacnb3P54285 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacnb3P54285 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cacnb3P54285 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacnb3P54285 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacnb3P54285 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacnb3P54285 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cacnb3P54285 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Cacnb3P54285 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cacnb3P54285 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cacnb3P54285 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Cacnb3P54285 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cacnb3P54285 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cacnb3P54285 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cacnb3P54285 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cacnb3P54285 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Cacnb3P54285 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cacnb3P54285 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cacnb3P54285 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cacnb3P54285 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cacnb3P54285 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cacnb3P54285 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cacnb3P54285 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cacnb3P54285 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cacnb3P54285 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cacnb3P54285 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms