Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms