Protein–RNA interactions for Protein: P51448

Rora, Nuclear receptor ROR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RoraP51448 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RoraP51448 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RoraP51448 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RoraP51448 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RoraP51448 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RoraP51448 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RoraP51448 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RoraP51448 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RoraP51448 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RoraP51448 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RoraP51448 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RoraP51448 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RoraP51448 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RoraP51448 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RoraP51448 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RoraP51448 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RoraP51448 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RoraP51448 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RoraP51448 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RoraP51448 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RoraP51448 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RoraP51448 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RoraP51448 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RoraP51448 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RoraP51448 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RoraP51448 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RoraP51448 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RoraP51448 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RoraP51448 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RoraP51448 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RoraP51448 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RoraP51448 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RoraP51448 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RoraP51448 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RoraP51448 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RoraP51448 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RoraP51448 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RoraP51448 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RoraP51448 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RoraP51448 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RoraP51448 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RoraP51448 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RoraP51448 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RoraP51448 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RoraP51448 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RoraP51448 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
RoraP51448 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RoraP51448 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RoraP51448 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RoraP51448 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RoraP51448 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RoraP51448 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RoraP51448 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RoraP51448 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RoraP51448 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RoraP51448 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RoraP51448 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RoraP51448 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RoraP51448 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RoraP51448 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RoraP51448 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RoraP51448 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RoraP51448 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RoraP51448 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RoraP51448 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RoraP51448 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RoraP51448 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RoraP51448 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RoraP51448 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RoraP51448 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RoraP51448 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RoraP51448 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RoraP51448 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RoraP51448 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RoraP51448 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RoraP51448 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RoraP51448 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RoraP51448 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RoraP51448 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RoraP51448 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RoraP51448 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RoraP51448 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RoraP51448 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RoraP51448 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RoraP51448 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RoraP51448 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RoraP51448 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RoraP51448 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RoraP51448 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RoraP51448 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RoraP51448 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RoraP51448 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RoraP51448 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RoraP51448 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RoraP51448 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RoraP51448 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RoraP51448 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RoraP51448 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RoraP51448 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RoraP51448 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms