Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa8P50706 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa8P50706 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa8P50706 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa8P50706 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa8P50706 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa8P50706 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa8P50706 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Defa8P50706 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Defa8P50706 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Defa8P50706 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Defa8P50706 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Defa8P50706 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms