Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
FmodP50608 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FmodP50608 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FmodP50608 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FmodP50608 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FmodP50608 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FmodP50608 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FmodP50608 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
FmodP50608 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
FmodP50608 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FmodP50608 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FmodP50608 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FmodP50608 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FmodP50608 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
FmodP50608 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
FmodP50608 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FmodP50608 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FmodP50608 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FmodP50608 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FmodP50608 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FmodP50608 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FmodP50608 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
FmodP50608 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FmodP50608 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FmodP50608 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FmodP50608 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FmodP50608 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FmodP50608 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FmodP50608 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FmodP50608 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FmodP50608 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FmodP50608 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FmodP50608 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FmodP50608 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FmodP50608 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FmodP50608 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FmodP50608 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FmodP50608 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FmodP50608 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FmodP50608 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FmodP50608 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FmodP50608 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FmodP50608 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FmodP50608 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FmodP50608 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FmodP50608 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FmodP50608 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FmodP50608 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FmodP50608 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FmodP50608 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FmodP50608 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FmodP50608 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FmodP50608 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FmodP50608 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FmodP50608 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FmodP50608 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FmodP50608 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FmodP50608 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FmodP50608 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FmodP50608 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FmodP50608 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FmodP50608 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FmodP50608 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FmodP50608 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FmodP50608 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FmodP50608 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FmodP50608 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FmodP50608 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FmodP50608 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FmodP50608 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FmodP50608 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FmodP50608 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FmodP50608 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FmodP50608 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FmodP50608 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FmodP50608 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FmodP50608 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FmodP50608 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FmodP50608 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FmodP50608 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FmodP50608 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FmodP50608 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FmodP50608 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FmodP50608 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FmodP50608 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FmodP50608 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FmodP50608 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FmodP50608 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FmodP50608 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FmodP50608 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FmodP50608 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FmodP50608 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FmodP50608 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FmodP50608 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FmodP50608 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FmodP50608 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FmodP50608 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FmodP50608 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FmodP50608 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FmodP50608 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms