Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LtbrP50284 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LtbrP50284 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LtbrP50284 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LtbrP50284 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LtbrP50284 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LtbrP50284 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LtbrP50284 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LtbrP50284 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LtbrP50284 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LtbrP50284 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LtbrP50284 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LtbrP50284 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LtbrP50284 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LtbrP50284 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LtbrP50284 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LtbrP50284 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LtbrP50284 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LtbrP50284 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LtbrP50284 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LtbrP50284 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LtbrP50284 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
LtbrP50284 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
LtbrP50284 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.33■■□□□ 1
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