Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psen1P49769 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psen1P49769 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psen1P49769 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psen1P49769 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psen1P49769 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Psen1P49769 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Psen1P49769 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Psen1P49769 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Psen1P49769 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Psen1P49769 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Psen1P49769 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Psen1P49769 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Psen1P49769 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Psen1P49769 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Psen1P49769 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms