Protein–RNA interactions for Protein: P49615

Cdk5, Cyclin-dependent-like kinase 5, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5P49615 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cdk5P49615 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms