Protein–RNA interactions for Protein: P49582

Chrna7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna7P49582 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna7P49582 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna7P49582 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna7P49582 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna7P49582 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna7P49582 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna7P49582 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna7P49582 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna7P49582 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna7P49582 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna7P49582 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna7P49582 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna7P49582 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna7P49582 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna7P49582 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna7P49582 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna7P49582 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna7P49582 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna7P49582 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna7P49582 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna7P49582 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna7P49582 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna7P49582 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna7P49582 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna7P49582 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna7P49582 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna7P49582 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna7P49582 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna7P49582 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna7P49582 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna7P49582 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna7P49582 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna7P49582 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna7P49582 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Chrna7P49582 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrna7P49582 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Chrna7P49582 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Chrna7P49582 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrna7P49582 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Chrna7P49582 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrna7P49582 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrna7P49582 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrna7P49582 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Chrna7P49582 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Chrna7P49582 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrna7P49582 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Chrna7P49582 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Chrna7P49582 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Chrna7P49582 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Chrna7P49582 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Chrna7P49582 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Chrna7P49582 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrna7P49582 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrna7P49582 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrna7P49582 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrna7P49582 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrna7P49582 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Chrna7P49582 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrna7P49582 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrna7P49582 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrna7P49582 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrna7P49582 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Chrna7P49582 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrna7P49582 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Chrna7P49582 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna7P49582 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna7P49582 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna7P49582 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna7P49582 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna7P49582 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna7P49582 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna7P49582 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna7P49582 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna7P49582 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna7P49582 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna7P49582 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Chrna7P49582 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna7P49582 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna7P49582 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna7P49582 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna7P49582 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna7P49582 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna7P49582 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna7P49582 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna7P49582 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna7P49582 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna7P49582 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna7P49582 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna7P49582 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Chrna7P49582 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Chrna7P49582 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrna7P49582 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrna7P49582 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrna7P49582 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Chrna7P49582 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Chrna7P49582 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrna7P49582 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrna7P49582 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Chrna7P49582 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrna7P49582 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms