Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtpreP49446 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PtpreP49446 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtpreP49446 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtpreP49446 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtpreP49446 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtpreP49446 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtpreP49446 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtpreP49446 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtpreP49446 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms