Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prox1P48437 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prox1P48437 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prox1P48437 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prox1P48437 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prox1P48437 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Prox1P48437 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Prox1P48437 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prox1P48437 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms