Protein–RNA interactions for Protein: P48299

Edn3, Endothelin-3, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn3P48299 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Edn3P48299 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Edn3P48299 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Edn3P48299 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Edn3P48299 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Edn3P48299 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Edn3P48299 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Edn3P48299 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Edn3P48299 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Edn3P48299 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Edn3P48299 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Edn3P48299 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Edn3P48299 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Edn3P48299 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Edn3P48299 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Edn3P48299 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Edn3P48299 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Edn3P48299 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Edn3P48299 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Edn3P48299 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Edn3P48299 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Edn3P48299 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Edn3P48299 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Edn3P48299 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Edn3P48299 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Edn3P48299 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Edn3P48299 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Edn3P48299 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Edn3P48299 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Edn3P48299 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Edn3P48299 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Edn3P48299 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms