Protein–RNA interactions for Protein: P47867

Scg3, Secretogranin-3, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg3P47867 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scg3P47867 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scg3P47867 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scg3P47867 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scg3P47867 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scg3P47867 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scg3P47867 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scg3P47867 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scg3P47867 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scg3P47867 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scg3P47867 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scg3P47867 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scg3P47867 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scg3P47867 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scg3P47867 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scg3P47867 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scg3P47867 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scg3P47867 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scg3P47867 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Scg3P47867 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scg3P47867 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scg3P47867 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scg3P47867 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scg3P47867 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scg3P47867 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scg3P47867 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scg3P47867 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scg3P47867 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scg3P47867 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scg3P47867 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Scg3P47867 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scg3P47867 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scg3P47867 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scg3P47867 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scg3P47867 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Scg3P47867 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Scg3P47867 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Scg3P47867 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Scg3P47867 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Scg3P47867 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scg3P47867 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scg3P47867 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scg3P47867 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scg3P47867 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scg3P47867 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scg3P47867 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scg3P47867 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms