Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syt1P46096 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syt1P46096 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syt1P46096 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Syt1P46096 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Syt1P46096 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syt1P46096 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syt1P46096 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syt1P46096 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Syt1P46096 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Syt1P46096 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syt1P46096 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syt1P46096 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syt1P46096 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syt1P46096 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syt1P46096 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syt1P46096 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syt1P46096 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syt1P46096 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syt1P46096 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syt1P46096 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms