Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtgfrP43117 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms